La medicina tradizionale cinese comprende non solo la medicina Han, ma anche quella delle varie minoranze etniche. Nel corso del loro sviluppo, influenzate da fattori geografici e culturali, le varie minoranze hanno creato vari tipi di medicine dai colori speciali, tra cui quelle tibetana, mongola, Uygur e coreana nonchè le medicine delle etnie Dai, Yi, Miao, Lagu e Elunchun.

Per via delle differenze storiche e culturali tra le varie minoranze, lo sviluppo della medicina etnica risulta ben diverso. Alcune medicine etniche non solo dispongono di svariati metodi di diagnosi, ma hanno anche formato una loro teoria medica peculiare. Alcune minoranze posseggono solo pochi testi medici sparsi fra la popolazione, il cui lavoro di riordino è ancora in corso. Per alcune medicine etniche, non esistono documenti scritti, si sono solo tramandate singole ricette o semplici metodi di diagnosi da valorizzare e riordinare ulteriormente.

Oltre ad assorbire la medicina Han, alcune medicine etniche hanno preso a prestito le medicine di altri paesi, arricchendo il loro contenuto. La medicina tibetana, ad esempio, ha assorbito non solo la medicina Han, ma anche quella mongola; la medicina mongola ha assorbito non solo la medicina Han e quella tibetana, ma anche quella russa.